程乃珊第一部小说《妈妈教唱的歌》发表于《上海文学》1979年第7期。1982年江苏人民出版社出版了她的第一部短篇小说集《天鹅之死》。她的作品曾先后结集为《丁香别墅》(中、短篇小说集,上海文艺出版社1986年出版)、《女儿经》(中篇小说集,花城出版社1988年出版)等。程乃珊在学校工作期间创作了以杨浦棚户区为背景的小说《穷街》。
程乃珊的《欢乐女神的故事》获上海市优秀作品奖,中篇小说《蓝屋》获首届“钟山”文学奖、上海蜂花杯优秀小说奖,《蓝屋》、《穷街》、《女儿经》获上海青年敦煌文学奖,长篇小说《银行家》获首届《文汇》月刊双鹿文学奖。